NSUN3 (NOP2/Sun RNA-Methyltransferase-Familienmitglied 3) ist ein Gen, das eine RNA-Methyltransferase kodiert, die an der Modifikation mitochondrialer tRNAs beteiligt ist. Diese Modifikation ist wichtig für die korrekte mitochondriale Proteinsynthese und Funktion. Mutationen im NSUN3-Gen wurden mit mitochondriellen Erkrankungen in Verbindung gebracht.